Uma sala de estudos com capacidade para até 10 estudantes, com conexão a internet (sala Erlhich), localizada no Prédio da Biblioteca.
Três salas de aula (Cezário Mota, Sala de Seminários e Lemos Monteiro), com capacidade para até 36 alunos cada, com facilidades como multimídia e ponto para conexão via rede.
Anfiteatro do Museu Biológico: Capacidade para até 150 pessoas e facilidades como multimídia, sistema de som e acesso a internet,
Anfiteatro do Museu de Microbiologia: Capacidade para até 50 pessoas e facilidades como instalação de multimídia e acesso à internet,
Anfiteatro do Centro de Difusão Cultural: Capacidade para até 50 pessoas e facilidades como instalação de multimídia e acesso a internet,
Anfiteatro do Laboratório Especial de Toxinologia: Capacidade para até 30 pessoas e facilidades com multimídia e acesso a internet,
Área de exposição do Centro de Difusão Cultural, disponível para apresentação de trabalhos em forma de painéis ou realização de oficinas didáticas.
Secretaria acadêmica dotada de sala e mobiliário, computadores com conexão com a internet e com duas funcionárias do corpo permanente do Instituto Butantan, treinadas e atuando exclusivamente para atender as demandas dos alunos, dos docentes e administrativas do Programa.
